近日,国家大宗淡水鱼产业技术体系种质资源鉴定与新种质创制岗位、淡水渔业研究中心唐永凯研究员团队,在建鲤30K液相育种芯片 “鲤芯一号”研制上取得新进展。
该团队基于前期对鲤基因组功能位点的分析及学界已报道的鲤经济性状相关位点,成功研发了建鲤30K液相育种芯片——“鲤芯一号”。该芯片包含32150个高质量SNP位点,均匀覆盖全基因组50条染色体,涵盖饲料效率、生长速度、代谢等经济性状相关位点,建鲤、黄河鲤等5个不同鲤品种的差异性位点,以及基因组上多态性的骨架位点。芯片性能测试中,31份样本(含1个重复)的核心靶位点基因分型成功率(检出率)达到97.59%,重复样本的基因分型一致率高达98.27%,证实芯片具备良好的可靠性和一致性。“鲤芯一号”聚焦经济性状,兼顾品种差异性位点,可有效应用于育种改良和种质资源鉴定。此外,作为低密度液相育种芯片,其使用、分析、维护及迭代成本均低于传统芯片,且芯片内位点更便于增删。
该系列研究工作得到国家大宗淡水鱼产业技术体系(CARS-45)、水科院淡水中心基本科研业务费(2024JBFR09)等项目支持。相关研究成果论文发表于国际期刊《Aquaculture》(JCR一区,IF 3.9)、《Animals》(JCR一区,IF 2.7)上。
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